Meski begitu, Bautista memilih hengkang dari Ducati pada akhir musim kala itu, usai cekcok dengan CEO Ducati Motor Holding, Claudio Domenicali.
Kabarnya Bautista hengkang karena masalah finansial yang rumit dengan Ducati.
Bautista kemudian bergabung dengan proyek baru Honda Racing Cooporation (HRC) di WorldSBK.
Proyek HRC tampak menarik buat Bautista yang kala itu sedang kesal dengan Ducati, apalagi kabarnya tawaran uangnya juga lebih besar.
Baca Juga: Bos MotoGP Berkomentar Soal Peluang Marc Marquez Gantikan Sosok Valentino Rossi
Sayangnya Bautista tidak cukup sukses bersama CBR1000RR-R Fireblade dan menjadi pembalap papan tengah selama 2 tahun ini.
Selama membela Team HRC, Bautista baru meraih satu podium.
Saat ini ia tengah duduk di peringkat 11 pada klasemen pembalap dengan koleksi 92 poin.